케이블은 일반 RJ-45 Cat5 급을 사용하시면 됩니다. 두 시스템을 다이렉트로 연결하더라도 crossover 케이블을 사용할 필요는 없습니다. 네트워크 카드에서 알아서 바꿔줍니다. Cat6 급을 사용하면 더 좋겠지만, 짧은 거리 안에서는 별 차이 없습니다.
하드 드라이브의 전송량으로는 기가비트 이더넷의 대역폭을 채우기에 역부족입니다. 특히 단 두대라면 대역폭을 전부 쓴다는게 불가능합니다. 대역폭 테스트 프로그램을 돌린다면 모르겠군요.
32bit PCI 슬롯으로는 기가비트 이더넷의 대역폭을 전부 지원하기에 부족합니다만, 일반적으로 대역폭을 꽉 채울 정도로 데이터를 전송하는 경우가 거의 드물기 때문에 실제로 대역폭이 제한되는 것은 느끼기 힘듭니다.
참고삼아 추천한다면, 기가비트 컨트롤러는 인텔에서 생산한게 제일 괜찮은것 같습니다. 가격이 싼 편이고, 성능이나 호환성 면에서 나무랄데 없습니다.
짧은글 일수록 신중하게.