생물정보학 프로그램에 사용할 계획인데 프로그램이 리눅스용, 윈도우용이 따로 있어 2대를 구성해야 할 것 같습니다. 사용하는 프로그램은 주로 대용량 수치 데이터를 다루는 것들입니다. 14k x 50 개의 실수계산을 합니다. 통계분석, db, 그래픽 작업들입니다. 웹 서비스도 필요한데 1일 평균 사용자가 50명 이내일 것으로 예측합니다. 예산은 약 900만원이구요. 완제품보다 조립이 가격대성능비가 높을 것 같습니다.
대략 작업내용을 말씀드리면 약 1번의 실험으로 약 50Mb 정도의 tiff 이미지를 얻습니다. 이 이미지는 2가지 색을 가지는 14k 개의 둥근 점들로 구성되어 있는데 각 점들을 구성하는 픽셀의 밝기를 측정하여 기본 통계량을 측정하고 점의 모양이나 색의 분포가 일정한지 측정합니다. 여기에서 얻은 값을 통계분석하고 (엑셀, Matlab, s-plus, r package, spss 등) 얻은 결과를 db로 저장합니다. 통계는 기본통계량을 구하고 permutation, principal component, clustering 등을 수행합니다. 그림파일도 db화 하구요. 이것이 한 실험이고 이러한 실험을 계속하는 것이지요. 수백번은 될 겁니다. 그리고 원격지에 있는 연구자가 이 컴퓨터에 접속해서 자기의 실험결과를 업로드하고 분석한 후 결과를 다운로드하는 서비스를 수행하려고 합니다. 이러한 프로그램이 윈도우용이 있는 반면 리눅스 전용도 있어서 두 시스템이 모두 필요합니다.
약 2-5GB 정도의 플랫파일db를 perl을 이용하여 검색하고 input data와 유사성을 찾아내는 알고리즘을 이용하여 필요한 내용을 뽑아내는 작업도 합니다.
다음의 사양을 생각해 보았습니다.
M/B MSD Supermicro X5DP8-G2 (Intel E7501 chipset) 1,360,000
CPU Intel Xeon 2.8 (512K 533MHz) 612,000 x 2
RAM 삼성 DDR PC2100 ECC/REG 1G 520,000 x 8
CASE Amaquest VS-6300B 340,000
HDD 73G SCSI320 560,000 x 4
RAID Adaptec ASR 2010S KIT 385,000
POWER 550W ATX-12V 250,000
CD-RW LG GCE-8520B 52x 105,000
MONITOR
K/B
MOUSE wheel
여기에 리눅스를 깔아 데이터 분석에 쓰고 일반 펜티엄pc에 윈도우를 깔아 웹서비스를 할까 합니다.
조언 부탁합니다.
짧은글 일수록 신중하게.