주로 리눅스 기준으로 답변드리겠습니다.
>제 전공이 해양환경 분야인데,
>간단히 얘기하자면 해수유동 등을 포트란으로 계산하는 일이 많습니다.
>환경과 관련된 생태모델을 돌리게 되면 보름에서 한달까지 계산이 돌아갑니다.
기본적으로 하시는 일은 저와 비슷하군요..
포트란, 수치 모델, 긴 적분 시간... 등등
>본론으로 들어가서, 컴퓨터 여러 대를 병렬로 연결하여 계산을 분산시켜 프로그램을 돌릴 수 있다고 들었습니다. 타학과 모연구실에서는 15대를 연결하여 계산을 돌린다는 얘기도 들었습니다.
>어떻게 시스템을 구축해야 할지를 몰라서 이렇게 질문을 드립니다. 지금 컴퓨터 한대로 돌리는 경우보다 더욱 속도를 단축시킬 수 있을것 같아서 실험실에 시스템을 구축하고자 합니다.
네 단축됩니다. 그러나 문제는 소스 코드 자체가 병렬화(MPI) 되어 있어야 합니다.
지금 사용하시는 코드를 확인하시기 바랍니다. 코드가 복잡하다면 코드 병렬화에 의외로 많은 시간을
들여야 할 수도 있습니다.
>시스템 구축에 대한 방법에 대해서 조언을 구합니다.
조언을 얻는 가장 좋은 방법은 주변에 클러스터링해서 쓰는 사람들을 접촉하는 것이 좋을 듯 합니다.
의외로 고려해야 할 것이 많습니다. 또 한가지 방법은 클러스터링 솔루션을 판매하는 업체와
상의하는 것도 한가지 방법입니다. 이 경우 직접 구축하는 것 보다 비용이 많이 상승합니다.
쪽지 주시면 업체는 알려드릴 수 있습니다. 여기에 쓰면 간접 광고라는....
>그리고 제가 상기에 질문한 내용이 실제 계산에서 유리한가에 대해서도 궁금합니다.
코드의 병렬화 정도가 좋다면 실제 계산에서 많이 유리합니다. 클러스터링의 경우 또 한가지 장점이
경우에 따라서 고용량의 메모리를 필요하는 계산에 대해서입니다.즉 8기가 정도의 메모리를
필요로 하는 응용 프로그램의 경우 8개의 노드에 1기가씩의 메모리가 있어도 수행 가능하다는 것이죠.
한개의 메인 보드의 8기가의 메모리를 설치하는 것 보다 비용 측면에서 많은 장점이 있습니다.
>그리고 어느 운영체제에서도 가능한지도 궁금합니다.
윈도우, 리눅스, 유닉스 등에서 가능합니다. 비용의 측면에서는 리눅스가 가장 저렴합니다.
윈도우는 사용되는 노드의 갯수에 따라 비용이 달라집니다.
대부분의 리눅스의 경우 클러스터링이 가능합니다. 기본 배포판에 적당한 mpi 라이브러리만 설치하시면
됩니다. 실제 계산의 경우 기가빗 스위칭을 쓰신다면 8-12노드까지는 scalability가 괜찮습니다.
이 이상의 노드간 통신 대역폭을 원하신다면 가격이 많이 상승합니다.
리눅스에서의 포트란은 주로 포틀랜드 그룹의 컴파일러를 사용하며 라이센스 한개당 비용이 대략
15-20만원 정도입니다.(정확히 기억이 나지 않습니다.) 이렇게 한개의 라이센스를 구매하시면
리눅스 2대, 윈도우 2대(확실하지 않음)에 설치할 수 있는 라이센스 키를 받을 수 있습니다.
>현재 유닉스나 리눅스를 능숙히 다룰 수 있는 사람이 없어서 윈도우로 사용하고 있습니다. 리눅스나 유닉스에서 포트란 계산을 하기 위해 필요한 지식에 대해서도 추천하실만한 책이 있으시면 답변부탁드립니다.
>아는 것이 거의 없어 갑갑하기만 하네요. 제가 도움을 받을 수 있는 사이트나, 이 분야에 대해서 공부할 수 있는 서적을 추천해 주시기를 바랍니다.
대부분의 리눅스는 비슷합니다. 설정 관련 파일의 위치나 GUI의 차이 정도입니다. OS에 대해서는
한글로 되어 있는 책 아무거나 사서 보시면 됩니다.
클러스터링에 대한 한글 책은 본 적이 없습니다.
좋은 한글 참고 문서는 kldp.org에 가셔서 검색해 보시면 됩니다.
다음의 책은 국내 대학 도서관에 제법 들어와 있습니다. 그림이 적어서 그렇지 어려운 영어는 아닙니다.
Linux clustering : building and maintaining Linux clusters
Bookman, Charles / New Riders / 2003 /
윈도우 버젼도 있습니다. 참고하시길
체계적인 답변이 되지 못해서 죄송합니다. 클러스터링의 경우 사용하시는 코드의 병렬화가 우선입니다.
이것이 확보되지 않으면 시스템을 구축하는 것이 의미가 없어집니다. 저의 경우 현재 4개 노드, 8cpu를
병렬화 하여 사용중이며 만족할 만한 성능을 보여주고 있습니다.
계획하시는 일 잘 되기를 바랍니다. 좋은 하루...
짧은글 일수록 신중하게.