안녕하세요. 같은 질문을 다시 드리게 되었습니다.ㅠ
우선, 제가 사용하는 프로그램을 실행시키면 아래 그림과 같이 나옵니다.
중간에 "6번", "1번"과 같이 선택하는것도 나오구요. 그런데 궁금한 것은
위의 작업을 스크립트로 만드려고 하는데,
아래와 같이 짜 봤습니다.
그런데 스크립트로 프로그램을 실행을 시키면 아래 그림처럼,
위에서 프로그램 명령어로 실행했을 때 처럼 모든 정보들이 출력이 안됩니다.
위의 그림과 똑같이 출력이 되게 하고싶은데 어떻게 하는지 모르겠습니다.
제가 짠 코드에 대해서 조언 부탁드려 봅니다. (참고로 저는 매우매우 초보입니다. 쉽게 알려주시면 감사하겠습니다.)
p = Popen(['grep', 'f'], stdout=PIPE, stdin=PIPE, stderr=STDOUT)
grep_stdout = p.communicate(input=b'one\ntwo\nthree\nfour\nfive\nsix\n')[0]
print(grep_stdout.decode())
우선, decode라는 이름이 정의되지 않았다고 에러가 떠서
아래와 같이 수정해 보았는데,
input_file = "1L2Y.pdb"
command = "gmx pdb2gmx -f {0} -ignh -ter" .format(input_file)
gmx_pdb2gmx = Popen(command, stdin=PIPE, stdout=PIPE, shell=True, universal_newlines=True)
stdout = gmx_pdb2gmx.communicate(input="6\n1\n")[0]
print(stdout)
stderr=STDOUT을 포함시키니까, 원래 출력되지 않던 정보들이 추가로 출력이 되어서 제거를 했습니다.
그러니 원하는 정보들만 화면에 다 출력이 되긴합니다.
그런데 출력되는 정보들의 순서들이 뒤죽박죽입니다....
순서를 바로 할 수도 있을까요?