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포맷을 막으려면 결국 write를 막을 수 밖에 없습니다. 소프트웨어적으로는 diskpart를 통해서 readonly attribute를 활성화하는 방법이 있고, 하드웨어적으로는 Write blocker를 활용할 수 있습니다.
다만, 어느 쪽이건 특정 파일/영역에 대한 쓰기를 선택적으로 허용하지는 못합니다.
전문적인 백업 솔루션을 갖추기가 힘들거나 그정도 레벨까지 갈 만한 수준은 아니라고 판단 되신다면 결국은 네트워크 인프라를 보강해서 실시간 또는 주나 일 단위의 네트워크 백업을 하시는게 좋을거 같습니다.
네트워크 사정이 좋지 않다고 하셨는데 정확히 어떤 상황이신가요?
https://social.technet.microsoft.com/Forums/en-US/19f772b7-225b-40a2-b45a-d4473004a234/how-to-disable-format-option-in-drivecde-windows-7-through-group-policy-window-2012-std-r2?forum=winservergen