안녕하세요,
대학 연구실에서 생물정보 분석용으로 사용할 타워 서버를 알아보고 있습니다.
지금은 Tyan 2U 서버를 쓰고 있는데요 (E5-2640 v2 *2, 램 256 GB),
사용자도 늘어나고 메모리도 가끔 부족해서 새로 슈마 서버를 알아보는 중입니다.
그런데, 원래 실험을 주로 하는 연구실이다 보니 아는 것이 거의 없습니다.
CPU부터 걸리는데요, 제온 골드 5220과 6240 사이에서 고민 중입니다.
6240이 5220보다 백만원 이상 비싼데요, 성능 차이가 어느 정도일까요?
연구실에서 사용하는 프로그램은 딱히 정해져 있지 않고 그때그때 필요한 대로 깔아서 쓰고 있는데요, 멀티코어 활용하는 프로그램들의 사용 빈도가 갈수록 커지고 있습니다.
미리 감사드립니다.
같은 시스템을 하나더 장만하시는 것이 어떨까 생각합니다
누가 관리하는지는 모르겠지만 시스템에 신경쓸 겨를이 없지 않나요
그냥 같은 시스템 하나 더 장만하시는 것이 관리가 편할 거 같습니다
벤더 서버같은 멋있는 서버 장만했다가 까다로운 문제 걸리면 골치 아플 수 있습니다
컴도 관리에 나름 신경 많이 쓰입니다 연구에 지장이 없는 시스템이 좋지 않을까요
아는 시스템을 하나 더 가 좋다고 생각합니다
# of AVX-512 FMA Units : 1 or 2
Scailable Processor가 E5-2600 V4에 비하여 그다시 성능 향상이 적은데..
AVX512-FMA 지원이 새롭게 들어와
딥러닝과 단정밀 배정밀도 연산에서 속도 향상이 되었습니다..
참고하세요..
가격대 성능비로 따지면 제온 V3, V4가 더 가성비가 좋습니다.
(1) 안 그래도 어쩌다 보니 제가 서버를 관리하게 됐는데, 아는 것도 없이 관리하다 보니 신경도 많이 쓰이고 시간도 꽤 뺏기고 있습니다.
그러나 연구책임자 분과 이미 새 시스템을 구매하기로 얘기가 된 상태이고, 현재 시스템은 램 256 GB가 최대인데 앞으로 해야 될 작업들을 위해서는 램이 500 GB 정도 달린 서버가 필요한 상황입니다.
(2) 게시글에는 안 적었지만 E5-V3/V4 도 알아보고 있었는데요, 단종이라면 아무래도 접어야 할 것 같네요.
메모리 최대 12T까지 지원합니다
우리 장터에 있어요
참고요
R830, R730도 메모리 500기가 이상 지원합니다
우리 장터에 있는 것도 있네요
해당 대학교의 서류상 결격 사유가 없고 구매과
에서 볼 때 이상 없어야 합니다..
아마 1천만원 이상 부터 입찰 필수 일 겁니다..
담당 교수님이 보통 책임져야 하기에 문제가
있어서는 안 됩니다..
저희 학교 규정은 2천만원 이상 경쟁입찰 필수였던 것 같은데, 다시 확인해 봐야겠네요.
도움 말씀들 감사드립니다.
나눠서 쓰고 있습니다. 빵빵한 서버 한대 보다는 적당한 서버나 웍스 두대도 사용자 분산시키는게 더 낫지 않을까요?
그리고 어떤 프로그램 쓰시는지 잘 모르겠지만, 리소스 적게 먹는 프로그램 새로 나온거 계속 찾아 보세요.
일례로 저는 NGS QC Toolkit 쓰다가 fastp로 바꾸니 작업시간이 거의 1/50 로 줄어들더군요. bowtie2 대신에 kallisto 쓰니까 또 시간 엄청 줄어들구요.
저희처럼 실험을 주로 하는 연구실에서는 연구비로 서버를 구매할 기회가 잘 없다 보니까, 기회 왔을 때 최대한 좋은 사양으로 일단 한 대 뽑아 놓아야 된다는 생각을 하게 되는 것 같습니다. 아무튼 이번에 새로 하나 사면 서버가 2대가 될 테니까, 말씀해 주신 대로 작업을 분산시키는 방법을 고민해 봐아겠네요.
메모리는, 말씀하신 de novo assembly 문제도 있구요, 최근에 메타지놈 분석을 좀 하다 보니까 메모리랑 씨피유 둘 다 많이 잡아줘야 쓸만하게 돌아가는 프로그램들도 있는 것 같습니다.
말씀해 주신 프로그램들은 한 번 살펴볼께요. 저희처럼 프로그램 설치도 낑낑대면서 하는 사람들은 어지간하면 쓰던 프로그램 계속 쓰려는 안 좋은 습성이 있습니다. 최근에는 conda 덕분에 많이 편해졌지만요.
감사합니다.
뭐 합의하시면 코웍하시면 어떨까요
잘하는 분야만하시면 되는 것입니다
1/50!!! 덜덜덜 이런 속도 향상은 최고급 정보입니다