연구용 워크스테이션에 관해 문의 드립니다.

Fibula   
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이번에 임용받은 초짜 교수입니다.


연구실을 셋팅하는 중인데 연구용 워크스테이션을 구매하고자 합니다.

사실 본업은 생물학 쪽이라 분석용 워크스테이션 사양에 대해 도통 모르겠습니다.

이전에 일했던 직장에서도 분석은 기관 공용 서버를 주로 사용했었습니다.

사실 실험이 주 업무고 분석은 곁다리 형식으로만 해서 어떤 사양으로 맞춰야 할지 감이 안옵니다.


집에서 쓰는 개인용 컴퓨터는 직접 조립도하고 오버클럭도 하고 그러는데,

워크는 벤더 베어본 제품에 제온 CPU. ECC 램 넣고 쓴다는 것 말고는 잘 모르겠습니다.

주 용도는 유전자 정보 분석이고 R 기반으로 돌아가는 프로그램이나 리눅스에서만 구동되는 프로그램들이 많습니다.


짧은 식견에서 되는데로 정보를 모아보니 R을 주로 사용하면 코어보다는 클럭빨과 램이 중요하다고 하는데 클럭과 램이 올라가면 가격이 굉장히 비싸지더군요 ㅜㅠ


예산은 500 정도에서 좀 무리하면 1000 정도 까지 쓸 수 있을 것 같습니다.

위와 같은 용도면 개략적인 사양을 어느 정도로 구성하면 괜찮을까요?


아는게 너무 없어서 무식해 보이는 질문이겠지만 고견 부탁드립니다.

짧은글 일수록 신중하게.
XEONG GOLD 6154 2개 활용한 웍스 구성하시면 좋을 것 같습니다.
     
Fibula 2019-09
예산이 한정되어 있어서 6154 2개 까지는 무리일 것 같습니다 ㅜㅠ 램도 어느정도 넣어야 될 것 같은데 그것도 얼마나 넣어야 될지 감이 잘 안오네요
하셀호프 2019-09
예전에 일하시던 곳의 공용 서버는 어느 정도 사양이었나요?
     
Fibula 2019-09
사용자 계정을 신청하고 돌릴 때마다 쓰레드 몇 개 쓸지 지정하도록 해서 구체적 사양은 잘 모르겠습니다. 별 생각 없이 그냥 사용하기만 했는데 알아놓을 것을 그랬네요. 서버실 만드는데 2~3억 이상 들었다고 풍문으로는 들었습니다. 서버 CPU 정보만 알아도 좀 수월할 것 같긴한데 한 번 알아보도록 하겠습니다.
          
하셀호프 2019-09
일반적으로 몇개 쓰레드를 지정해서 사용하셨나요?
만일 교수님 혼자 쓰신다면 사용하시던 쓰레드를 기준으로 생각하시면 될 것 같구요
R 기반이나 파이썬 사용시 분석 시스템의 규모에 따라 메모리를 산정하시면 되지 않을까요
예전 일하시던 곳의 공용 서버 관리자를 아시나요?
아마도 이런 종류의 질문에 답해 주실 수 있을 것 같습니다
               
Fibula 2019-09
당시에는 개인당 6~8개 이상 쓰지말라고 제한을 해서 보통 그 정도 범위 안에서 사용했었는데 작업이 오래 걸린다는 느낌을 받긴 했습니다.
말씀하신대로 서버 관리자 분에게 메일을 드려보겠습니다. 빠른 길을 두고 돌아가고 있었는듯 합니다 ㅜㅠ
여러 조언에 감사드립니다.
gmltj 2019-09
어떤 프로그램인지 모르는데.... 프로그램 파는 업체에 문의를 하심이....
     
Fibula 2019-09
아 본문에 오해의 소지가 좀 있었네요. 정확히는 상용 프로그램이 아니라 연구자들이 만든 R 패키지나 파이썬 등으로 직접 만든 프로그램들 입니다.
진돌슈빈 2019-09
연구비로 구매를 해야되는지요? 중고로 구매를 한다면
생물학분석이면 코어와 램을 많이 사용하고 genome분석에는 GPU는 아직
 E5-2690 v4나 E5-2697 v3 x2 이면 single thread점수와 core수가 어느정도 되고
램은 128이상으로 맞추셔야 될 것 같고요
Scalable Xeon에 새제품이면 1000정도면 맞출수 있지않을까요?
     
Fibula 2019-09
네 연구비로 구매해야 합니다. 고가 장비로 들어가서 실제 구매는 본부의 구매부서 같은데서 비교견적? 그런 식으로 진행되서 중고는 힘들 것 같습니다. 램 용량을 어디까지 해야되는지가 고민이었는데 역시 크게 가야 되는군요. 감사합니다.
박문형 2019-09
요즘 스케일러블 제온도 조금 바뀐게

스케일러블 프로세서는 점점 단종되어 갑니다.. X1XX 모델

2세대 스케일러블( Cascade Lake)프로세서가 다나와에 등장하기 시작했습니다.. X2XX 모델



아이스케어 제온이 보드가 개발되고 있으며 내년 9월쯤 나오지 않을까 전망됩니다..


계속 흐름은 바뀌고 있으니 잘 생각하시고 구매하시기 바랍니다..

학교인지라 싼 것이라면 슈퍼마이크로 그 외는 대기업 벤더 제품밖에 사용하시기가 힘들겠네요..

교수님의 재량으로 특정 제품을 고집할 수도 있지만 연구결과가 좋지 않으면 왕따 당하기 쉽습니다..

구매과랑 잘 상의해보시기 바랍니다..
     
Fibula 2019-09
연구비를 이번 하반기 이내에 집행해야되서 기다릴만한 여유가 있을지 잘 모르겠습니다.
2세대가 언제쯤 시장에 풀릴까요? 2세대 풀리는 시점에 1세대 가는게 손해보는 것 같긴하나 시간 상 안 맞으면 어쩔 수 없이 1세대로 가야될 것 같습니다 ㅜㅠ
렌탈 쪽은 클라우드 서비스들을 좀 찾아봤었는데  제가 다루는 수준에서는 가성비가 잘 맞지 않아서 일단은 워크스테이션으로 갈까 생각 중입니다.
조언 감사드립니다.
          
박문형 2019-09
다나와와 벤더 웍은 많이 다릅니다..

델과 HP를 보시고 견적을 받아보세요..
               
Fibula 2019-09
네 추천해주신 델과 HP 제품 견적을 받아보도록 하겠습니다. 조언 감사합니다.
박문형 2019-09
그 외 슈퍼컴퓨터센터의 슈퍼컴퓨터를 사용하실수 있는 계정 정도는 있으실 듯한데

그쪽을 랜탈해서 결과를 얻어내는게 더 싸게 먹힐 수도 있습니다..

문제는 결과 데이터량이 방대해지면 어디 잘 보관해야 하는데 그게 아마 가장 힘든 일이 될수도 있습니다..

보안 문제도 발생할 수 있고요..
제온프로 2019-09
게놈 유전자 분석서버는 기본적으로
메모리 1테라
CPU 4개..
보통 이렇게 합니다..
     
Fibula 2019-09
아마 제가 사용하던 서버 사양은 그랬을 것 같은데 1인용 워크스테이션으로 전환하려니 어느 선으로 정해야 될지 잘 모르겠습니다.
행복단지 2019-09
전에 근무하시던 회사 서버실 꾸미는데 2~3억 들었다면 실제 메인으로 사용하셨던 서버는 1억~1.5억 정도 하지 않았을까 생각됩니다.
이전 : [메인 서버의 자원을 여러명이서 쪼개서 사용] - 현재 : [ 1인 독자 사용 워크스테이션]
이제는 1대의 워크스테이션을 독자 사용하는 환경이니 실제로는 엄청난 고스펙의 워크스테이션이 아니어도 충분히 사용하실 만 할 수도 있습니다.
일단 주변에서 구할 수 있는 웍스나 PC중에서 가장 고성능 컴퓨터에 시험 삼아서 기존에 사용하셨던 프로그램을 돌려서 완료되는 시간을 측정해보세요.
그러시면 이전에 작업하셨던 것과 비교 되어 어느정도 감이 오실 듯 합니다.
(ps. 프로그램 소스가 오픈되어도 상관 없는 벤치용 테스트 프로그램을 만들수 있다면, 회원님들께 부탁 드려 보는것도 좋은 방법 같습니다.)
     
Fibula 2019-09
말씀해주신대로 공용 서버를 쓰다가 독자 1인 워크로 전환하려하니 도통 감이 잡히지 않았습니다 ㅜㅠ 예전에 집에서 연습용으로 코드를 짜서 돌려본 적이 있습니다. 라이젠 2600에 4.0 오버하고 램 16기가 오버 상태로 돌려봤는데 연습용이라 데이터로 쓰지는 않았지만 서버실 보다는 좀 더 빨랐던 것 같습니다. 이전 경험을 참고해서 사양을 알아보도록 하겠습니다. 조언 감사합니다.
          
하셀호프 2019-09
우리 장터에 R930이라는 괴물이 있습니다
이놈 cpu 개당 10개 코어 20개 쓰레드 가능한  cpu  사용할 수 있고
cpu 최대 4개까지 사용할 수 있습니다
그러니까 최대 40 코어 80 쓰레드가 가능합니다
물론 전기 많이 먹습니다
amd 라이젠 3세대도 좋은 선택일 수 있구요
               
Fibula 2019-09
추천해 주신 제품 확인했습니다. 학교 전기라 사실 전기 먹는 것은 걱정이 아닌데 문제는 연구비라서 중고 매매가 안됩니다 ㅜㅠ 좋은 제품 추천 감사합니다.
                    
Dreaday 2019-09
장터상품 중고아니에요!
          
행복단지 2019-09
AMD 2600으로 사용하셨을때에도 쓸만하다고 판단이 되셨다면 벤더사 1 CPU 웍스로 구성하시는걸 추천드리구요.
다만, 예산상의 문제로 벤더 제품이 고민 된다면 가성비 모델로 AMD의 쓰레드리퍼 2950X에 메모리 128GB 정도 구성하시면 좋을것 같습니다.
               
Fibula 2019-09
금액이 크다보니 아무래도 벤더사 제품을 사용하는게 향후 관리하기에 좋을 것 같아 일단 벤더사 워크스테이션을 1순위로 고려하고 있습니다. 예산을 고려해서 추천해주신 벤더사의 1 CPU 웍스 구성을 알아보도록 하겠습니다. 조언 감사합니다.
악마라네 2019-09
이번에 웍스테이션 견적 후 구매 과정을 밟고 있습니다. 역시 연구비 입니다. 금액을 보니 어쩔 수 없이 사양은 타협하셔야 합니다.

500만원이라면 싱글 웍스테이션 1000만원이면 듀얼 웍스테이션이 불가능해보이진 않습니다만, 주로 사용하시는 패키지가 R과 Python이라면, 메모리가 중요할 것으로 생각됩니다.

DELL 기준으로 5820T Barebone + W2195 CPU + 256G 메모리 하면 VAT 별도 500만원은 가볍게 넘어서지 않을까 합니다. 메모리는 여기 장터에서 저렴한 가격에 사넣을 수 있으니, 메모리 기본 용량 정도만 맞추고 나머지는 최고로 올려서 구매해보심이 어떨런지요. 고민하지 마시고 DELL 에 상담 요청 넣어 보시면 매우 잘 알려줍니다. HP도 마찬가지 일거라고 생각합니다.
     
Fibula 2019-09
경험에서 우러나온 조언 감사합니다. 다다익램이군요. 메모리를 여기서 싸게 구매할 수 있는지는 생각도 못했네요. 연구비 집행은 힘들테니 용돈을 털어서라도 사야겠습니다. 마침 집에 NAS 용으로 쓰던 WD RED 8TB 2개 3TB 2개가 있는데 이것도 떼다가 연구실에서 써야겠습니다 ㅜㅠ 추천해주신대로 가급적 다른 요소들의 사양을 올리고 추가 구매할 수 있는 부분들은 절약하도록 해야겠습니다. 추천해주신 DELL과 HP 모두 견적 상담을 받아보도록 하겠습니다. 조언 감사합니다.
          
악마라네 2019-09
가장 최근에 예산에 맞추어서 웍스테이션 하나를 발주중입니다. 5820T + W2145 CPU + 16G *2 + 500G HDD. (아직 입고전입니다. ㅎㅎㅎ)
그래서 최근 정보가 있습니다.
               
Fibula 2019-09
구체적인 사양 정보 알려주셔서 감사합니다. 말씀해주신 사양 정보 참고하여 견적 내 보도록 하겠습니다.
박문형 2019-09
메모리는 DDR4 Reg ECC 32GB PC-21300 모듈이나 DDR4 Reg ECC 64GB PC-21300 모듈이면 좋은데..

64G 모듈은 흔하지 않고 가격이 꽤 비쌀 것입니다..
     
Fibula 2019-09
제한된 예산에서 진행해야 되니 신경 쓸 부분들이 많은 것 같습니다. 가급적이면 추천해주신 32 GB 모듈로 구성해보도록 하겠습니다.
변선주 2019-09
임용 축하드립니다.
저야 유전체 분석을 하지는 않지만, R을 사용하신다면 코어 수 적고, 클럭 높고, 메모리 많게 구축하시면 어떨까 싶습니다.
     
Fibula 2019-09
감사합니다^^ 다들 메모리를 많이 가져가라고 추천해 주셔서 램은 빵빵하게 구성해야 겠습니다. CPU 라인업이 워낙 다양해서 코어와 클럭을 어느 수준에서 조정해야 될지 고민입니다.
남수 2019-09
임용 축하드립니다.

저는 아직 연구생이지만, 직접 서버/워크스테이션을 구매 진행해보니 결국은 Dell / 슈퍼마이크로 사 에서 견적을 받아서 구매하였습니다 (연구사업이다 보니까...상황이 똑같네요)

경험 상 그분들도 아주 모르지는 않으니 윗분들이 말씀하신대로 돌려볼 수 있는 예제 프로그램이 있고 ~~한 정도를 원한다 하면 어느정도는 맞춰주시는거로 알고있습니다.


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