이번에 임용받은 초짜 교수입니다.
연구실을 셋팅하는 중인데 연구용 워크스테이션을 구매하고자 합니다.
사실 본업은 생물학 쪽이라 분석용 워크스테이션 사양에 대해 도통 모르겠습니다.
이전에 일했던 직장에서도 분석은 기관 공용 서버를 주로 사용했었습니다.
사실 실험이 주 업무고 분석은 곁다리 형식으로만 해서 어떤 사양으로 맞춰야 할지 감이 안옵니다.
집에서 쓰는 개인용 컴퓨터는 직접 조립도하고 오버클럭도 하고 그러는데,
워크는 벤더 베어본 제품에 제온 CPU. ECC 램 넣고 쓴다는 것 말고는 잘 모르겠습니다.
주 용도는 유전자 정보 분석이고 R 기반으로 돌아가는 프로그램이나 리눅스에서만 구동되는 프로그램들이 많습니다.
짧은 식견에서 되는데로 정보를 모아보니 R을 주로 사용하면 코어보다는 클럭빨과 램이 중요하다고 하는데 클럭과 램이 올라가면 가격이 굉장히 비싸지더군요 ㅜㅠ
예산은 500 정도에서 좀 무리하면 1000 정도 까지 쓸 수 있을 것 같습니다.
위와 같은 용도면 개략적인 사양을 어느 정도로 구성하면 괜찮을까요?
아는게 너무 없어서 무식해 보이는 질문이겠지만 고견 부탁드립니다.
만일 교수님 혼자 쓰신다면 사용하시던 쓰레드를 기준으로 생각하시면 될 것 같구요
R 기반이나 파이썬 사용시 분석 시스템의 규모에 따라 메모리를 산정하시면 되지 않을까요
예전 일하시던 곳의 공용 서버 관리자를 아시나요?
아마도 이런 종류의 질문에 답해 주실 수 있을 것 같습니다
말씀하신대로 서버 관리자 분에게 메일을 드려보겠습니다. 빠른 길을 두고 돌아가고 있었는듯 합니다 ㅜㅠ
여러 조언에 감사드립니다.
생물학분석이면 코어와 램을 많이 사용하고 genome분석에는 GPU는 아직
E5-2690 v4나 E5-2697 v3 x2 이면 single thread점수와 core수가 어느정도 되고
램은 128이상으로 맞추셔야 될 것 같고요
Scalable Xeon에 새제품이면 1000정도면 맞출수 있지않을까요?
스케일러블 프로세서는 점점 단종되어 갑니다.. X1XX 모델
2세대 스케일러블( Cascade Lake)프로세서가 다나와에 등장하기 시작했습니다.. X2XX 모델
아이스케어 제온이 보드가 개발되고 있으며 내년 9월쯤 나오지 않을까 전망됩니다..
계속 흐름은 바뀌고 있으니 잘 생각하시고 구매하시기 바랍니다..
학교인지라 싼 것이라면 슈퍼마이크로 그 외는 대기업 벤더 제품밖에 사용하시기가 힘들겠네요..
교수님의 재량으로 특정 제품을 고집할 수도 있지만 연구결과가 좋지 않으면 왕따 당하기 쉽습니다..
구매과랑 잘 상의해보시기 바랍니다..
2세대가 언제쯤 시장에 풀릴까요? 2세대 풀리는 시점에 1세대 가는게 손해보는 것 같긴하나 시간 상 안 맞으면 어쩔 수 없이 1세대로 가야될 것 같습니다 ㅜㅠ
렌탈 쪽은 클라우드 서비스들을 좀 찾아봤었는데 제가 다루는 수준에서는 가성비가 잘 맞지 않아서 일단은 워크스테이션으로 갈까 생각 중입니다.
조언 감사드립니다.
델과 HP를 보시고 견적을 받아보세요..
그쪽을 랜탈해서 결과를 얻어내는게 더 싸게 먹힐 수도 있습니다..
문제는 결과 데이터량이 방대해지면 어디 잘 보관해야 하는데 그게 아마 가장 힘든 일이 될수도 있습니다..
보안 문제도 발생할 수 있고요..
메모리 1테라
CPU 4개..
보통 이렇게 합니다..
이전 : [메인 서버의 자원을 여러명이서 쪼개서 사용] - 현재 : [ 1인 독자 사용 워크스테이션]
이제는 1대의 워크스테이션을 독자 사용하는 환경이니 실제로는 엄청난 고스펙의 워크스테이션이 아니어도 충분히 사용하실 만 할 수도 있습니다.
일단 주변에서 구할 수 있는 웍스나 PC중에서 가장 고성능 컴퓨터에 시험 삼아서 기존에 사용하셨던 프로그램을 돌려서 완료되는 시간을 측정해보세요.
그러시면 이전에 작업하셨던 것과 비교 되어 어느정도 감이 오실 듯 합니다.
(ps. 프로그램 소스가 오픈되어도 상관 없는 벤치용 테스트 프로그램을 만들수 있다면, 회원님들께 부탁 드려 보는것도 좋은 방법 같습니다.)
이놈 cpu 개당 10개 코어 20개 쓰레드 가능한 cpu 사용할 수 있고
cpu 최대 4개까지 사용할 수 있습니다
그러니까 최대 40 코어 80 쓰레드가 가능합니다
물론 전기 많이 먹습니다
amd 라이젠 3세대도 좋은 선택일 수 있구요
다만, 예산상의 문제로 벤더 제품이 고민 된다면 가성비 모델로 AMD의 쓰레드리퍼 2950X에 메모리 128GB 정도 구성하시면 좋을것 같습니다.
500만원이라면 싱글 웍스테이션 1000만원이면 듀얼 웍스테이션이 불가능해보이진 않습니다만, 주로 사용하시는 패키지가 R과 Python이라면, 메모리가 중요할 것으로 생각됩니다.
DELL 기준으로 5820T Barebone + W2195 CPU + 256G 메모리 하면 VAT 별도 500만원은 가볍게 넘어서지 않을까 합니다. 메모리는 여기 장터에서 저렴한 가격에 사넣을 수 있으니, 메모리 기본 용량 정도만 맞추고 나머지는 최고로 올려서 구매해보심이 어떨런지요. 고민하지 마시고 DELL 에 상담 요청 넣어 보시면 매우 잘 알려줍니다. HP도 마찬가지 일거라고 생각합니다.
그래서 최근 정보가 있습니다.
64G 모듈은 흔하지 않고 가격이 꽤 비쌀 것입니다..
저야 유전체 분석을 하지는 않지만, R을 사용하신다면 코어 수 적고, 클럭 높고, 메모리 많게 구축하시면 어떨까 싶습니다.
저는 아직 연구생이지만, 직접 서버/워크스테이션을 구매 진행해보니 결국은 Dell / 슈퍼마이크로 사 에서 견적을 받아서 구매하였습니다 (연구사업이다 보니까...상황이 똑같네요)
경험 상 그분들도 아주 모르지는 않으니 윗분들이 말씀하신대로 돌려볼 수 있는 예제 프로그램이 있고 ~~한 정도를 원한다 하면 어느정도는 맞춰주시는거로 알고있습니다.