박문형 2021-12

견적은 견적이고 발주 넣었을때 딜러버리 타임과 발주 후와 물건 받았을때 가격 변화가 있느냐 없느냐가 문제겠죠..

코로나와 중국 전기 부족으로 물건 구하기가 많이 힘듭니다..

봄붐봄 2021-12

그렇군요..
저 중에 구하기 힘든 부품들도 있나보네요.

구차니 2021-12

유전체 검사 하는게 아닐까 조금 의심이 됩니다만.. 해당 용도가 맞다면 유전체 검사하시는 여기 회원분 계시니 조언구해보심이 좋을듯 합니다.

봄붐봄 2021-12

맞습니다.
사실 전 유전체를 거의 몰라서 저렇게 적어 놓긴했습니다.
관련 전문가 분께서 짜주신 견적이고 믿을만 하다고 생각되긴 하지만 돈이 돈인 지라 여기 전문가 분들께 한번더 확인하고자 여쭤보게 되었습니다.

dateno1 2021-12

그런데 소프트가 스레드 제대로 써먹을 수 있는 구조인가요?

그런게 아니라면 코어 개수만 많고, 클럭이 낮은 제온 실버로 돌리면 매우 느립니다

봄붐봄 2021-12

소프트가 소프트웨어를 말씀하시는건가요..? 잘 모르겠네요 ㅜ.ㅜ

dateno1 2021-12

어떤 소프트 돌리길껀지 몰라도 멀티 스레드로 안 되는 작업을 돌릴꺼면 코어 40개나 있어도 다 놀립니다

박문형 2021-12

소프트 = 소프트웨어 =응용프로그램

일반적으로 전문적으로 사용하는 응용프로그램 들은 크게 2가지 타입이 있습니다..


사용하시는 프로그램이 CPU 코어를 1개만 사용하는 경우 시스템에 아무리 CPU 코어가 많아도 다 놀게 됩니다..

이런 경우 CPU코어수는 적어도 CPU의 속도가 중요합니다..

반대로 사용하시는 프로그램이 시스템의 전체 CPU코어를 다 인식하고 사용하는 경우가 있습니다..

이런 특성을 가진 프로그램을 사용하는 경우 CPU의 속도는 좀 낮아도 CPU코어 갯수가 많을수록 빨리 돌아갑니다..



그 외 시스템 한 대에서 어느 갯수 이상의 CPU코어일때만 응용프로그램이 돌아가는 경우가 있습니다..

개발하는 프로그램이 아니고 판매하는 유료프로그램을 경우

사용하는 프로그램의 특성을 잘 모르시면  프로그램을 판매한 회사 혹은그 프로그램의 총판쪽에 기술문의를 해서

시스템 사양을 추천해달라면 추천해줍니다..

봄붐봄 2021-12

일단은 유료 프로그램을 쓰진 않고는 있는데,
그것도 한번 알아봐야겠네요.

구차니 2021-12

KVM이 필요한지 그리고 어댑터가 왜이렇게 많이 들어가는지에 따라서 약간의 비용을 절약가능하고
데이터 용량이 큰데 로컬 스토리지는 적은 편이라 RAID1 구성만 하실건지 아니면 10G로 NAS와 네트워크 구축해서 쓸지등을 결정하셔야 할 것 같습니다.
OS 스토리지 SSD 로 1개, 데이터로 SAS 1.5T * 2 인데 유전자 분석이 시퀀셜(쭈욱 읽어서 메모리에 올리고 한다면)하면 모르겠지만, 랜덤(곳곳을 읽어)하게 읽어야 한다면(그걸 줄이기 위해 메모리 2T를 하셨겠지만) 메인 스토리지를 엔터프라이즈 SAS SSD로 바꾸시는게 좋을듯 합니다.

그리고 파트넘버로 봤을때는 후지츠 제품 같은데 유지보수 까지 문제가 없는지 확인해두시는게 좋을듯 합니다.
https://www.fujitsu.com/global/products/computing/servers/primergy/rack/rx2540m6/#specs

스펙을 보니 메모리가 어마어마하네요..
그런데 몇명이 동시에 얼마나 큰 데이터를 처리할 예정인가요?

봄붐봄 2021-12

동시접속자수는 최대한 2~3명 정도 밖에 안될 것 같습니다.
큰 계산만 돌리기 위해서 구매하려고합니다.
데이터는 제가 전임자가 한 데이터를 보니 최고 큰 데이터는 80G 정도 되네요 -_-;;

구차니 2021-12

물리적으로 앉아서 하는게 아니라면 KVM도 굳이 필요없을 듯 합니다.
아무튼 커야 80G이고 2~3명이 돌리는데 2T 메모리는 너무 오버스펙이 아닐까 합니다.
512GB ~ 1T 정도로 낮추고, 스토리지에 좀 더 투자하시는게 전체적인 효용이 높아지지 않을까 합니다.

Yune 2021-12

ngs 하시나요? multiple alignment해도 2T까지는 안 쓸것 같아요. 엄청 큰 assembly 하시면 필요할 수도 있겠네요.
스토리지가 어떻게 되는지 모르겠으나 스토리지와의 속도를고려해 주세요. 데이터 읽고쓰는데에 병목이 일어날 가능성이 큽니다. 스토리지는 10G로 연결해 주세요.

봄붐봄 2021-12

네 내년도에는 NGS를 하려고 준비하려고니다. 지금 보니 80G 정도 되는 데이터를 denovo assembly 해야 할 것 같네요..