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안녕하세요.
저는 현재 생명과학쪽 대학원 연구실에서 윈도우즈 기반의 계산 서버 관리를 담당하고 있습니다.
현재 사용하는 서버가 노후되어 새 서버를 구매하려 알아보고 있는데, 제 컴퓨터 관련 지식이 많이 부족해서 질문 드립니다.
현재는
CPU : Intel Xeon E5-2687W v3 두 개 (총 코어 20 스레드 40)
메모리 : 256GB
이용중입니다.
지금까지 경험상, 작업관리자에서 CPU 점유율과 RAM 점유율을 확인했을 때
RAM은 점유율이 70%를 넘어간 적도 없고 해서 여유가 있는 것 같은데,
CPU 점유율은 동일 프로그램 두 세개만 동시에 돌리기만 해도 바로 점유율 100%를 찍고 버벅임이 느껴집니다.
(혹시 이런 경우, CPU가 저희 서버 성능의 바틀넥이라고 생각할 수 있는 부분일까요?)
저희가 이용하는 분석 프로그램은 "프로세서 수"를 지정하여 돌리는데, 이를 보통 20 이상을 설정해서 돌립니다.
이러한 프로그램을 구성원 여러 명이 각각 동시에 사용한다는 상황도 고려하여 저희에게 더 적합한 CPU를 고를 수 있을까 궁금했습니다.
CPU 사양 중 어떤 부분을 가장 주의깊게 고려해야 할까요?
가능한 예산 안에서 가장 비싼 것을 구매하면 될까요?
감사합니다.
잘은 모르지만
사용하시는 프로그램이 CPU 클럭도 높아야 하고 코어 갯수도 많아야 하는가 봅니다.. (메모리는 덤으로 많아야 하고)
사용하시는 2687W는 본래 워크스테이션용으로 특화된 모델이고 코어 갯수는 좀 작지만 클럭은 재일 높은 급에 있는 CPU 입니다..
거기에도 쓴 댓글이지만
다코어 연산이 중요한 프로그램이라면 제온 말고 EPYC 서버 도입도 고려해 보시면 좋습니다.
예를들어, 최신 사파이어래피즈 제온, EPYC4세대 기준으로 120코어 240쓰레드 제온 시스템 구성 비용보다 196코어 384쓰레드 에픽 시스템 구성 비용이 더 저렴합니다.
구지 이전세대 시스템을 사용하셔야 겠다면, 6326 보다는 EPYC 3세대 시스템을 알아보세요.
아이스레이크와 EPYC 3세대의 동일 코어 동일 클럭시 성능 차이가 무시 못할 수준입니다.
EPYC 3세대 24코어*2 시스템으로 구성 하시면 6326(16코어)*2 시스템보다 더 저렴하면서도 성능은 50% 넘게 좋은 구성이 나올겁니다.
코어 수가 2배 이상 늘어나고 IPC 개선도 있어서 경과가 좋다면 2940만원을 아끼는 결과가 나올 수 있습니다.
EPYC 호환 관련해서도 알아보고, CPU 교체도 생각해봐야겠네요.
감사합니다.
cuda 알고리즘 구현은 어려운가요?
감사합니다.
선택지는 너무 많아요.
일반 컴퓨터 돌려도
서버 역할을 하면 그건 써버입니다.
전체 예산은 삼천만원 선이며 하드나 램 등은 대략 생각해둔 크기가 있습니다.
저희가 사용하는 프로그램 특성상 CPU만 잘 골라보면 되는 건가 싶었는데, 이게 어렵네요 ㅠ
한 번 사면 5년 넘게 사용하려는 것이다 보니 확실한 성능 차이만 있겠다 싶으면 좀 더 보태서라도 좋은 것을 알아보려 하였습니다.
감사합니다.
사용하신 프로그램이 개선없이 계속 써야하는 상황이면 저도 2696v4 듀얼 구성으로
먼저 사용해보겠네요
첫번째 방법은 소프트웨어 라이센스에 제약이 없다면 머신을 여러대로 분리시키는겁니다. NLB로 분산을 시켜버리는거죠.
두번째는 계산이나 통계 및 분석용은 CPU가 장군입니다. 코어많은 최신 서버 CPU 라인업으로 하는거죠.
그리고 V3/V4 계열은 아무리 듀얼이여도 라이젠보다 후달립니다. 3000시리즈 보다도 못한거 같습니다.
라이센스 문제 없는거라면 저거 사용자마다 PC로 1:1로 최신 CPU로 때려 박아도 싸게 먹힐듯 싶네요.
그냥 제가 혼자 스무고개 해보자면... 메모리 부족은 아니라 하시니 시퀀스 어셈블리쪽은 아닌것 같고... GPU 연산을 아직 도입하지 않고 있다 하시니 3세대 시퀀서 raw data를 다루시는 것도 아닌것 같고... 윈도 기반이라면 CLC 워크벤치 쓰시나요? 프로그램 라이센스 때문에 컴을 한대 더 들이는게 곤란하다면 결국 시피유 업그레이드나 컴퓨터 교체가 방법일텐데, 2696v4 나 2699v4로 업그레이드 하는 방법이 있겠지요. 저는 리눅스에서 쓰레드리퍼 3960x 사용중인데, 당연하게도 제가 써 본 그 어떤 e5 v4 듀얼 제온보다 빠릅니다. 저라면 에픽으로 갈아타겠습니다. 그리고 장기적으로는 리눅스 도입을 추천합니다. 이것저것 해볼 수 있는게 확 늘어나요. 제 주변에 하드코어 BI 하는 분들은 전부 생물학 전공 출신들입니다.
저희는 proteomics 분야고 peptide database search 합니다.
그런데 분야 특성상 아직 CLI보다는 GUI로 된 tool들이 훨씬 많아서 윈도우즈를 쓰려 합니다.
프로그램이 저렇다 보니 당장은 GPU도 쓸일이 없을 것 같습니다.
CPU 교체를 가장 먼저 고려해봐야겠네요.
저희는 proteomics 분야고 peptide database search 합니다.
분야 특성상 아직 CLI보다는 GUI로 된 tool들이 훨씬 많습니다
컴알못이라 단순히 프로그램 돌려놓고 작업관리자에서 이용율만 확인해 CPU가 많이 잡힌다고 말씀드렸습니다 ㅠㅠ
다만 예산이 빡빡하다면 mmseqs 나 diamond와 같은 다른 tool로 갈아타는 것도 좋은 방법일 수 있습니다.
아 혹시나 DB가 하드에 올라가 있다면 일단 ssd로 옮기는게 최우선입니다